Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Vmn1r34G3XA52 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Vmn1r34G3XA52 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms