Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pcf11G3X9Z4 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Pcf11G3X9Z4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Pcf11G3X9Z4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms