Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Vmn1r58G3X9U3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Vmn1r58G3X9U3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms