Protein–RNA interactions for Protein: G3X8Y1

Trim55, MCG19772, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim55G3X8Y1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trim55G3X8Y1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trim55G3X8Y1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms