Protein–RNA interactions for Protein: G3X8R9

Tmigd3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd3G3X8R9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmigd3G3X8R9 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tmigd3G3X8R9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmigd3G3X8R9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms