Protein–RNA interactions for Protein: G3UW60

Susd5, MCG14773, mousemouse

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd5G3UW60 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Susd5G3UW60 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Susd5G3UW60 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms