Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Srp72F8VQC1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Srp72F8VQC1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms