Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ScaperF8VQ70 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ScaperF8VQ70 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ScaperF8VQ70 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms