Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ9

Bicra, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BicraF8VPZ9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
BicraF8VPZ9 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC35.04■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.01■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
BicraF8VPZ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
BicraF8VPZ9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms