Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Usp9yF8VPU6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usp9yF8VPU6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms