Protein–RNA interactions for Protein: F6ZIS7

Rarres1, Retinoic acid receptor responder (tazarotene-induced) 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rarres1F6ZIS7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rarres1F6ZIS7 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Rarres1F6ZIS7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms