Protein–RNA interactions for Protein: F6U3N7

Gm21977, Predicted gene 21977 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21977F6U3N7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm21977F6U3N7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Gm21977F6U3N7 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms