Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syngap1F6SEU4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Syngap1F6SEU4 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms