Protein–RNA interactions for Protein: F2Z461

Herc6, E3 ISG15--protein ligase Herc6, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Herc6F2Z461 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Herc6F2Z461 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Herc6F2Z461 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms