Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Cald1E9QA15 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cald1E9QA15 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cald1E9QA15 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms