Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

Predictions only

Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp31E9Q6Y8 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp31E9Q6Y8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
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