Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R7

Utrn, Utrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UtrnE9Q6R7 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UtrnE9Q6R7 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UtrnE9Q6R7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UtrnE9Q6R7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms