Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga10E9Q6R1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Itga10E9Q6R1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms