Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ythdc1E9Q5K9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ythdc1E9Q5K9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ythdc1E9Q5K9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms