Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5G2

Pcdhb9, Protocadherin beta 9, mousemouse

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdhb9E9Q5G2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pcdhb9E9Q5G2 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Pcdhb9E9Q5G2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pcdhb9E9Q5G2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms