Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DspE9Q557 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DspE9Q557 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
DspE9Q557 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
DspE9Q557 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
DspE9Q557 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms