Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4T4

Ccdc71l, Coiled-coil domain-containing 71-like, mousemouse

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Length 218 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccdc71lE9Q4T4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Ccdc71lE9Q4T4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccdc71lE9Q4T4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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