Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
ApobE9Q414 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
ApobE9Q414 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
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