Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc171E9Q1U1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc171E9Q1U1 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
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