Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Lrp3E9Q1T6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Lrp3E9Q1T6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms