Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1I1

Gm3893, Predicted gene 3893, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3893E9Q1I1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gm3893E9Q1I1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gm3893E9Q1I1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gm3893E9Q1I1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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