Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Vmn1r68E9Q0V3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Vmn1r68E9Q0V3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms