Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Fndc1E9Q043 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Fndc1E9Q043 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Fndc1E9Q043 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms