Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sbf2E9PXF8 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sbf2E9PXF8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms