Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4931408C20RikE9PWP9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
4931408C20RikE9PWP9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
4931408C20RikE9PWP9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms