Protein–RNA interactions for Protein: E9PVZ3

Ccdc144b, Coiled-coil domain-containing 144B, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc144bE9PVZ3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc144bE9PVZ3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ccdc144bE9PVZ3 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc144bE9PVZ3 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms