Protein–RNA interactions for Protein: E9PV98

Trim5, Tripartite motif-containing 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim5E9PV98 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Trim5E9PV98 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trim5E9PV98 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trim5E9PV98 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms