Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
Soga1E1U8D0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Soga1E1U8D0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Soga1E1U8D0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms