Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Vpreb3D3Z6J4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Vpreb3D3Z6J4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms