Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T8

4930407I10Rik, RIKEN cDNA 4930407I10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930407I10RikD3Z5T8 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
4930407I10RikD3Z5T8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
4930407I10RikD3Z5T8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
4930407I10RikD3Z5T8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms