Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc8D3YZV8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc8D3YZV8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms