Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ccdc170D3YXL0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ccdc170D3YXL0 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms