Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd1D3YXK1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd1D3YXK1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms