Protein–RNA interactions for Protein: D3YW29

Rexo5, RNA exonuclease 5, mousemouse

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo5D3YW29 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rexo5D3YW29 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rexo5D3YW29 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rexo5D3YW29 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms