Protein–RNA interactions for Protein: D3YVL2

Cfap70, Cilia and flagella-associated protein 70, mousemouse

Predictions only

Length 1,141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap70D3YVL2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cfap70D3YVL2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cfap70D3YVL2 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cfap70D3YVL2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms