Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK8

1700015F17Rik, RIKEN cDNA 1700015F17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700015F17RikD3YUK8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
1700015F17RikD3YUK8 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700015F17RikD3YUK8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms