Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Tmf1B9EKI3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tmf1B9EKI3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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