Protein–RNA interactions for Protein: B9EK86

Vmn1r180, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r180B9EK86 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vmn1r180B9EK86 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vmn1r180B9EK86 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms