Protein–RNA interactions for Protein: B9EJV3

Greb1l, GREB1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Greb1lB9EJV3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Greb1lB9EJV3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Greb1lB9EJV3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Greb1lB9EJV3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms