Protein–RNA interactions for Protein: B9EJ80

Pdzd8, PDZ domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd8B9EJ80 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pdzd8B9EJ80 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pdzd8B9EJ80 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms