Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.39■□□□□ 0.54
Cped1B2RX70 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cped1B2RX70 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms