Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Cfap58B2RW38 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cfap58B2RW38 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms