Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Clrn2B2RVW2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Clrn2B2RVW2 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Clrn2B2RVW2 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms