Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
AU015836B2RUM3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
AU015836B2RUM3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms