Protein–RNA interactions for Protein: B2RT54

Apol7a, Apolipoprotein L 7a, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol7aB2RT54 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Apol7aB2RT54 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Apol7aB2RT54 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Apol7aB2RT54 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms